MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori PeCan18 chromosome

Total Repeats: 29575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017742	TGAG	2	8	27	34	25 %	25 %	50 %	0 %	386755085
2	NC_017742	T	6	6	35	40	0 %	100 %	0 %	0 %	386755085
3	NC_017742	TGA	3	9	121	129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755085
4	NC_017742	T	6	6	259	264	0 %	100 %	0 %	0 %	386755085
5	NC_017742	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755085
6	NC_017742	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	386755085
7	NC_017742	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	386755085
8	NC_017742	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755085
9	NC_017742	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386755085
10	NC_017742	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386755085
11	NC_017742	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	386755085
12	NC_017742	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386755086
13	NC_017742	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	386755086
14	NC_017742	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386755086
15	NC_017742	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	386755086
16	NC_017742	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755086
17	NC_017742	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	386755086
18	NC_017742	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755086
19	NC_017742	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	386755087
20	NC_017742	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755087
21	NC_017742	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386755087
22	NC_017742	CCG	4	12	1043	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386755087
23	NC_017742	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386755087
24	NC_017742	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386755087
25	NC_017742	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	386755087
26	NC_017742	T	6	6	1243	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	386755087
27	NC_017742	CTA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755087
28	NC_017742	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	386755087
29	NC_017742	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	386755087
30	NC_017742	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386755087
31	NC_017742	CTTG	2	8	1456	1463	0 %	50 %	25 %	25 %	386755087
32	NC_017742	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	386755087
33	NC_017742	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	386755087
34	NC_017742	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755087
35	NC_017742	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755087
36	NC_017742	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755087
37	NC_017742	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755088
38	NC_017742	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	386755088
39	NC_017742	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	386755088
40	NC_017742	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	386755088
41	NC_017742	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	386755088
42	NC_017742	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	386755088
43	NC_017742	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755088
44	NC_017742	T	6	6	1976	1981	0 %	100 %	0 %	0 %	386755088
45	NC_017742	TTC	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755088
46	NC_017742	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386755088
47	NC_017742	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755088
48	NC_017742	TTAA	2	8	2057	2064	50 %	50 %	0 %	0 %	386755088
49	NC_017742	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386755088
50	NC_017742	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755088
51	NC_017742	G	7	7	2188	2194	0 %	0 %	100 %	0 %	386755088
52	NC_017742	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	386755088
53	NC_017742	A	8	8	2541	2548	100 %	0 %	0 %	0 %	386755089
54	NC_017742	CTTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	386755089
55	NC_017742	T	7	7	2637	2643	0 %	100 %	0 %	0 %	386755089
56	NC_017742	TGA	2	6	2662	2667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755089
57	NC_017742	GC	3	6	2790	2795	0 %	0 %	50 %	50 %	386755089
58	NC_017742	A	6	6	2828	2833	100 %	0 %	0 %	0 %	386755089
59	NC_017742	GTG	2	6	2966	2971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386755089
60	NC_017742	AGA	2	6	3064	3069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755089
61	NC_017742	AAGA	2	8	3072	3079	75 %	0 %	25 %	0 %	386755089
62	NC_017742	CAAA	2	8	3100	3107	75 %	0 %	0 %	25 %	386755089
63	NC_017742	GTG	2	6	3125	3130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386755089
64	NC_017742	GCC	2	6	3132	3137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386755089
65	NC_017742	TGC	2	6	3217	3222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386755090
66	NC_017742	GAAA	2	8	3247	3254	75 %	0 %	25 %	0 %	386755090
67	NC_017742	GAAA	2	8	3322	3329	75 %	0 %	25 %	0 %	386755090
68	NC_017742	CA	3	6	3364	3369	50 %	0 %	0 %	50 %	386755090
69	NC_017742	TG	3	6	3429	3434	0 %	50 %	50 %	0 %	386755090
70	NC_017742	GTT	2	6	3578	3583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755090
71	NC_017742	ATC	2	6	3662	3667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755090
72	NC_017742	AGAA	2	8	3778	3785	75 %	0 %	25 %	0 %	386755090
73	NC_017742	CAG	2	6	3824	3829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386755090
74	NC_017742	A	6	6	3866	3871	100 %	0 %	0 %	0 %	386755090
75	NC_017742	A	6	6	3889	3894	100 %	0 %	0 %	0 %	386755090
76	NC_017742	ATT	2	6	3906	3911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386755090
77	NC_017742	TGT	2	6	3917	3922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755090
78	NC_017742	GGC	2	6	3979	3984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386755090
79	NC_017742	CCATG	2	10	5520	5529	20 %	20 %	20 %	40 %	386755091
80	NC_017742	TCGC	2	8	5543	5550	0 %	25 %	25 %	50 %	386755091
81	NC_017742	CATT	2	8	5616	5623	25 %	50 %	0 %	25 %	386755091
82	NC_017742	ATT	2	6	5638	5643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386755091
83	NC_017742	C	6	6	5701	5706	0 %	0 %	0 %	100 %	386755091
84	NC_017742	TGG	2	6	5736	5741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386755091
85	NC_017742	A	6	6	5813	5818	100 %	0 %	0 %	0 %	386755091
86	NC_017742	A	6	6	5848	5853	100 %	0 %	0 %	0 %	386755091
87	NC_017742	CTT	2	6	5876	5881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755091
88	NC_017742	T	6	6	5880	5885	0 %	100 %	0 %	0 %	386755091
89	NC_017742	GTT	2	6	5938	5943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755091
90	NC_017742	TTA	2	6	6065	6070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386755091
91	NC_017742	GTG	2	6	6134	6139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386755091
92	NC_017742	GC	3	6	6196	6201	0 %	0 %	50 %	50 %	386755091
93	NC_017742	CAA	2	6	6202	6207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386755091
94	NC_017742	TGT	2	6	6255	6260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755091
95	NC_017742	C	6	6	6300	6305	0 %	0 %	0 %	100 %	386755091
96	NC_017742	TTGAT	2	10	6410	6419	20 %	60 %	20 %	0 %	386755091
97	NC_017742	CGCTTG	2	12	6439	6450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386755091
98	NC_017742	GCG	2	6	6513	6518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386755091
99	NC_017742	TTGCT	2	10	6527	6536	0 %	60 %	20 %	20 %	386755091
100	NC_017742	CGA	2	6	6564	6569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386755091
101	NC_017742	TCA	2	6	6683	6688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755091
102	NC_017742	TTG	2	6	6797	6802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755091
103	NC_017742	ACT	2	6	6811	6816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755091
104	NC_017742	T	7	7	6839	6845	0 %	100 %	0 %	0 %	386755091
105	NC_017742	CAC	2	6	6861	6866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386755091
106	NC_017742	TCG	2	6	7068	7073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386755091
107	NC_017742	TGGT	2	8	7084	7091	0 %	50 %	50 %	0 %	386755091
108	NC_017742	AAC	2	6	7099	7104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386755091
109	NC_017742	TGCCAT	2	12	7125	7136	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386755091
110	NC_017742	CCG	2	6	7179	7184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386755091
111	NC_017742	ATCG	2	8	7267	7274	25 %	25 %	25 %	25 %	386755091
112	NC_017742	GCT	2	6	7294	7299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386755091
113	NC_017742	CGTT	2	8	7302	7309	0 %	50 %	25 %	25 %	386755091
114	NC_017742	GTT	2	6	7324	7329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755091
115	NC_017742	T	6	6	7375	7380	0 %	100 %	0 %	0 %	386755091
116	NC_017742	CAT	2	6	7819	7824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755092
117	NC_017742	GCC	2	6	7825	7830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386755092
118	NC_017742	TCT	2	6	7886	7891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755092
119	NC_017742	GAAACC	2	12	7934	7945	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386755092
120	NC_017742	AAT	2	6	7984	7989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386755092
121	NC_017742	CTT	2	6	7992	7997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755092
122	NC_017742	TTCA	2	8	8062	8069	25 %	50 %	0 %	25 %	386755092
123	NC_017742	CAT	2	6	8082	8087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755092
124	NC_017742	GC	3	6	8129	8134	0 %	0 %	50 %	50 %	386755092
125	NC_017742	ATG	2	6	8135	8140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755092
126	NC_017742	TCA	2	6	8159	8164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755092
127	NC_017742	CG	3	6	8194	8199	0 %	0 %	50 %	50 %	386755092
128	NC_017742	CTT	2	6	8232	8237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755092
129	NC_017742	CCG	2	6	8241	8246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386755092
130	NC_017742	T	6	6	8281	8286	0 %	100 %	0 %	0 %	386755092
131	NC_017742	AG	3	6	8341	8346	50 %	0 %	50 %	0 %	386755092
132	NC_017742	CAT	2	6	8436	8441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755092
133	NC_017742	GTG	2	6	8468	8473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386755092
134	NC_017742	TTC	2	6	8548	8553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755092
135	NC_017742	CCG	2	6	8567	8572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386755092
136	NC_017742	TTTCT	2	10	8598	8607	0 %	80 %	0 %	20 %	386755092
137	NC_017742	CAC	2	6	8668	8673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386755092
138	NC_017742	GAT	2	6	8710	8715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755092
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